1998 年，微软发布了 Visual Studio 6.0。所有开发语言的开发环境版本均升至 6.0。这也是 Visual Basic 最后一次发布，从下一个版本 (7.0) 开始，Microsoft Basic 进化成了一种新的面向对象的语言：Microsoft Basic NET。由于微软公司对于 Sun 公司 Java 语言扩充导致与 Java 虚拟机不兼容被 Sun 告上法庭，微软在后续的 Visual Studio 中不再包括面向 Java 虚拟机的开发环境。 2002 年，随着 .NET 口号的提出与 Windows XP / Office XP 的发布，微软发布了 Visual Studio .NET（内部版本号为 7.0）。在这个版本的 Visual Studio 中，微软剥离了 Visual FoxPro 作为一个单独的开发环境以 Visual FoxPro 7.0 单独销售，同时取消了 Visual InterDev。与此同时，微软引入了建立在 .NET 框架上（版本1.0）的托管代码机制以及一门新的语言 C#（读作 C Sharp，意为 C#）。C# 是一门建立在 C++和 Java 基础上的现代语言，是编写 .NET 框架的语言。 .NET 的通用语言框架机制（Common Language Runtime, CLR），其目的是在同一个项目中支持不同的语言所开发的组件。所有 CLR 支持的代码都会被解释成为 CLR 可执行的机器代码然后运行。 Visual Basic、Visual C++ 都被扩展为支持托管代码机制的开发环境，且 Visual Basic .NET更是从 Visual Basic 脱胎换骨，彻底支持面向对象的编程机制。而 Visual J++ 也变为 Visual J#。后者仅语法同 Java 相同，但是面向的不是 Java 虚拟机，而是 .NET Framework。 2003 年，微软对 Visual Studio 2002 进行了部分修订，以 Visual Studio 2003 的名义发布（内部版本号为 7.1）。Visio 作为使用统一建模语言（UML）架构应用程序框架的程序被引入，同时被引入的还包括移动设备支持和企业模版。.NET 框架也升级到了 1.1。 2005 年，微软发布了 Visual Studio 2005。.NET 字眼从各种语言的名字中被抹去，但是这个版本的 Visual Studio 仍然还是面向 .NET 框架的（版本2.0）。[1] 这个版本的 Visual Studio 包含有众多版本，分别面向不同的开发角色。同时还永久提供免费的 Visual Studio Express 版本。 2007年11月，微软发布了 Visual Studio 2008。 2010年4月12，微软发布了 Visual Studio 2010 以及 .NET Framework 4.0。 2012年9月12日，微软在西雅图发布 Visual Studio 2012。